总分机构企业所得税汇总纳税规定主要依据《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》（国家税务总局公告2012年第57号）及后续政策调整，核心内容包括适用范围、税款分摊、备案要求、申报流程等。以下是关键要点：
一、适用范围
汇总纳税主体：居民企业在境内设立不具有法人资格的分支机构（二级及以下），需汇总计算并缴纳企业所得税。
例外情形（不就地分摊的二级分支机构）：
不具有主体生产经营职能的内部辅助性机构（如售后服务、内部研发、仓储）；
上年度认定为小型微利企业；
新设立或当年撤销的分支机构；
境外设立的不具有法人资格的分支机构。
二、税款分摊规则
分摊比例：
营业收入（权重0.35）、职工薪酬（权重0.35）、资产总额（权重0.30）。
总机构：分摊50%税款；
分支机构：分摊剩余50%，按三因素权重计算比例：
计算公式：
某分支机构分摊比例 = （该机构营业收入/各机构营业收入之和）×0.35 + （该机构职工薪酬/各机构职工薪酬之和）×0.35 + （该机构资产总额/各机构资产总额之和）×0.30
数据来源：上年度全年的营业收入、职工薪酬及12月31日的资产总额。
分摊步骤：
统一计算：总机构汇总全部应纳税所得额；
划分所得额：按分摊比例划分各分支机构应纳税所得额；
分别计税：若总分机构税率不同，先按各自税率计算税额后加总；
分摊税款：按比例向总机构和分支机构分配应缴税款。
2025年新计算方法（优化后）：
原方法：先计算整体应补（退）税额，再按比例分摊。
新方法：先按比例计算各机构全年应纳税额，再抵减预缴税款，直接得出补（退）税额，更准确处理预缴阶段分摊错误。
案例：甲公司汇缴应纳税额300万元，预缴250万元。分支机构A预缴比例错误（预缴按50%，实际应为30%），新方法下A可退回17.5万元，B需补缴37.5万元。
三、备案管理
备案主体：总机构及所有二级分支机构（包括不就地分摊的机构）。
备案内容：
总机构需报备所有二级及以下分支机构信息（名称、地址、识别号等）；
分支机构需报备总机构及下属机构信息。
变更要求：信息变化后30日内向主管税务机关备案。
四、申报流程
总机构申报：
A109000（年度分摊明细表）；
A109010（分支机构所得税分配表）。
填报《企业所得税年度纳税申报表（A类）》及附表：
分支机构申报：
仅需填报企业所得税预缴申报表（A类）主表中的第20-21行（分摊比例和分摊税额）。
需附送总机构所在地税务机关受理的《分配表》。
五、特殊情形处理
税率差异：
统一计算全部应纳税所得额；
按比例划分不同税率地区所得额；
分别计税后加总；
再按比例分摊。
总分机构适用不同税率时，需分步计算：
查补税款：
分支机构被查补税款的50%由总机构缴纳，50%由该分支机构就地缴纳。
建筑企业项目部：
省内项目部不就地预缴；省外项目部按实际经营收入的0.2%预缴。
六、违规处理
分支机构无法提供《分配表》或证明其二级身份的，视同独立纳税人就地缴纳企业所得税，且年度内不得变更。
七、2025年政策变化
申报表调整：优化《A109000》和《A109010》表样，强调“先分摊全年税款，再抵减预缴”的新计算逻辑。
附：分摊计算表示例
| 分支机构 | 营业收入（万元） | 职工薪酬（万元） | 资产总额（万元） | 分摊比例 | 分摊税额（万元） |
|---|---|---|---|---|---|
| B分公司 | 3500 | 700 | 1200 | 48.85% | 38.71 |
| C分公司 | 2000 | 450 | 800 | 30.48% | 24.16 |
| D分公司 | 1500 | 250 | 600 | 20.67% | 16.38 |
| 合计 | 7000 | 1400 | 2600 | 100% | 79.25 |
| 注：总机构分摊50%（79.25万元），分支机构合计分摊50%（79.25万元）。 |
以上规定确保跨地区经营企业税负公平，同时通过分级管理保障地方税收利益。操作时需密切关注年度政策更新（如2025年新计算方法），并确保备案信息及时准确。
